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開發一種生物熒光檢測HIV病毒載量監測 | |||
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以下三種通用的方法是目前在發展中國家來檢測和量化HIVRNA的可供選擇:反轉錄聚合酶鏈反應(RT-PCR),核酸序列的擴增(NASBA),和支鏈DNA(的bDNA)。每一種方法需要三個步驟:樣品制備和病毒核酸的提取,從檢測對象的病毒RNA,并檢測和/或擴增產物定量所產生的靶核酸序列或信號放大6RT-PCR使用反向轉錄酶轉化病毒RNA到互補DNA(cDNA),然后復制,因此可以被檢測到。在該方法中,RT-PCR定量HIVRNA,使測定病毒負荷。6是NASBA擴增的等溫方法,其中,靶RNA是由3-酶系統放大,并通過競爭性共擴增的控制量化。這種方法消除了對所使用用于RT-PCR的熱穩定酶和熱循環儀器。-PCR),核酸序列擴增(NASBA)和支鏈DNA(的bDNA)。對照品
RT-PCR使用逆轉錄酶酶病毒的RNA轉化為互補DNA(互補),然后復制,因此可以被檢測到在這種方法中,RT-PCR量化艾滋病毒的RNA,使病毒載量的決心,目前,以下四個市售的病毒載量檢測所有使用這些通用的方法之一:科瓦斯AmpliPrep和科瓦斯的TaqManV2.0由羅氏分子系統,實時HIV-1由Abbott實驗室,Versant的HIV-1RNA1.0試驗(KPCR)由西門子醫療診斷和的NucliSENSEasyQHIV-1v2.0順次生物梅里埃公司。4,6科瓦斯的TaqManHIV-1的COBASTaqMan探針的HIV-1檢測是一種體外核酸目前,以下四個商用病毒載量分析所有一般使用其中的一個方法:科瓦斯AmpliPrep和科瓦斯的TaqMan2.0羅氏分子系統,實時的HIV-1由雅培公司,熟練的HIV-1RNA的1.0測定(KPCR)西門子醫療診斷,和的NucliSENSEasyQHIV-1V2.0梅里埃。
擴增檢測為HIV-1RNA在人類血漿中使用的COBASAmpliPrep儀自動試樣處理和自動化的擴增和檢測的COBASTaqMan探針分析儀或科瓦斯的TaqMan48分析儀定量。這是一個完全自動化的,實時PCR系統為目標的HIV基因組,從而導致檢測的下限雙方的插科打諢和LTR地區。6的COBASTaqMan探針HIV-1的檢測只需要一定的技術技能,具有較寬的動態范圍,是完全自動化(包括樣品轉移),并且只需要分析一個單間,但它也有一些缺點。為了進行的COBASTaqMan探針的HIV-1檢測,一些專用的實驗室空間和設備是必需的,適度的技術支持是必不可少的。該設備也是昂貴的,通常是超出了任何發展中世界的設施,可提供空間和支持的范圍。6實時HIV-1。雅培實時HIV-1檢測采用實時熒光定量PCR,但不像TaqMan探針,它的目標是在POLHIV基因組的整合區域。HIVRNA定量是使用m2000sp樣品制備和核酸的提取,并m2000rt用于擴增和檢測的自動化流程。6雅培實時檢測的主要優勢包括其高吞吐量,大動態范圍,而事實上,它可以是完全自動化的,封閉的系統中的PCR。此外,該設備可用于評估HIV之外的其他病原體。然而,與的COBASTaqMan探針,該系統需要專用的設備和空間,良好的技術支持,并有相當的資金投入。6Versant的HIV-1RNA的1.0。的Versant的HIV-1RNA1.0試驗(的bDNA)是一種自動檢測該還針對HIV基因組的聚合酶整合區域,使用樣品準備模塊和擴增/檢測模塊一次。6的Versant的測定法也具有高吞吐量和可以完全自動化,從而降低污染的風險較放大試驗定量的HIV-1RNA在人類血漿使用科瓦斯AmpliPrep儀器自動標本處理和科瓦斯的TaqMan分析儀或科瓦斯的TaqMan48分析儀自動放大和檢測。
目前的商用實時HIV病毒載量測定的表一,主要特點。(點擊圖片放大。)表一,當前商業實時HIV病毒載量的主要特征分析。(點擊圖片可放大)。PCR反應。沒有特殊的實驗室設置,或單獨提取區域是需要的,并且該設備還可以用于評估其他病原體。然而,Versant的檢測的主要缺點包括需要熟練的技術人員,良好的技術支持和財政資源。6的NucliSENSEasyQ。的的NucliSENSEasyQHIV-1的2.0版使用NASBA為目標的gag區擴增艾滋病毒和定量核糖核酸(見表I)。該測定游NASBA與實時檢測通過使用利用的NucliSENSEasyQ分析儀分子信標。9的的NucliSENSEasyQ分析提供高吞吐量的優勢與需要的唯一介質技能。它也是一個完全自動化的,封閉的系統。但是,它需要專門的空間和設備,并且有污染的高容量的實驗室危險。技術支持是必需的,增加了與此相關的試驗已經很高的成本.
NucliSENSEasyQ分析提供高吞吐量的優勢只有中等技能要求。這也是一個完全自動化的,封閉的系統,然而,它需要專用的空間和設備,有一個大容量實驗室的污染風險。技術支持是必需的,已經增加了高成本相關的分析。6
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