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自動顯微鏡載玻片病理分析 | |||
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個性化醫療的時代,也帶來了新的希望,更好的,更針對性的癌癥治療。它也策動爆炸免疫學和DNA為基礎的染色技術,創造了新的機遇和挑戰在病變區域。用于癌癥治療的分子測試的進展伴隨化療和放療的來臨,可能有一個對生存率的影響一樣大。然而,隨著高科技,因為它們可能是,這些測試的力量是有限的能力,具有豐富經驗的病理學家通過顯微鏡載玻片考試實現演繹的見解。
病理學家主要使用兩種染色方法在分子病理學,免疫組織化學(IHC)和熒光原位雜交(FISH)。IHC是用來測量抗體蛋白的表達方式,通過化學污漬可見。這種技術歷來集中在細胞的細胞或組是否表示一個特定的蛋白質,通常表明已存在或不存在的污垢。新的測試所要求的蛋白表達水平的定量分析,通過染色強度和模式和位置??在每個單元格中的染色。魚,在另一方面,是一個工具,以確定在單元格中的特定序列的DNA的存在,位置和數量。它正迅速成為識別基因擴增的首選方法。魚,熒光染色的DNA探針雜交的DNA序列,位于激發時產生的熒光燈。
病理IHC和FISH技術的改進,直到最近被匹配成像技術的進步。但自動化發展作出這方面,建立和維護的分析方法,其特征在于高的重復性和準確性的挑戰。在分析顯微鏡載玻片本文討論的病理學家面臨的挑戰,并認為新發展,如何在自動圖像分析,可以幫助克服這些困難,以及容納染色技術的進一步進步。
自動化減輕人眼的病理學家必須面對三個主要方面的挑戰,在各自的領域:生產力,準確性和客觀性。實驗室是越來越大的壓力下,以提高生產力,也就是說,完成更多的測試和處理更多的幻燈片。手動應對工作山資源,工作人員和財政上放置一個恒定的應變。在不久的將來,這個負擔可能會迅速惡化。
依賴于觀察在任何領域的科學性,準確性是至關重要的。然而,它報道說,經過長時間的視覺研究,眼睛和具體錐疲勞可以顯著地影響一個人的能力,辨別顏色的變化,并找出不尋常的物體。最后,還有一個客觀的問題。人眼的性質是這樣的,每個人看到一個對象從別人看到一個相同的對象的方式略有不同。因此,在這方面的主體是與生俱來的。此外,色彩和色調可以出現改變設置或上下文到另一個。看到對同一對象的不同特點,一個單一的觀察員可能在不同的時間,不同的觀察者可能會報告。
自動化可以提高病理學的實踐中,通過克服手動顯微鏡的局限性。有些好處是立即明顯。數字分析不會受疲勞。計算機可以被編程以識別視覺模式準確地,它們比人眼更好的檢測在著色和強度的微妙的變化。此外,電腦是一致的,公正的,客觀的分析觀察。一個典型的例子是特定的的錐疲勞,這是一種臨時色盲。當它折磨疲憊的病理學家,它會導致該人暫時無法注冊的顏色范圍。自動化儀器是不容易衰弱等。
事實上,圖像分析計算可以管理和處理大量的數據,以驚人的速度,沒有患任何人為的限制。應用成像公司(圣何塞),在20世紀90年代中期就開始在這方面的工作。其目的是自動化徒勞無益的病理解剖病理學家的眼球的能力相結合,與電源的數字圖像分析。計算機科學家,病理學家和成像工程師團隊的努力已導致在Ariol自動圖像分析系統(見圖1)。
Ariol提供了一個新的調查工具箱的病理學家。成像應用設計系統,以補充病理學家的經驗和培訓提出客觀,一致的,高分辨率的標本可以量化的結果的產生。該技術具有應用在各種病理設置,包括制藥和生物技術實驗室,癌癥研究機構,大學醫療中心和臨床病理實驗室。有望受益的醫療保健專業人士,其工作依賴于病理資料。
吞吐量的限制一直顯微鏡幻燈片分析的一大瓶頸。管理日益發展的今天山幻燈片和測試,需要一個系統,可以一次處理大量的幻燈片,并提供方便幻燈片處理和操作。,Ariol系統的滑動裝載機可管理多達50張幻燈片,在強大的托盤,便于運輸的幻燈片和顯微鏡階段(見圖2)。幻燈片可以自動掃描,甚至無人值守過夜和托盤可以不斷加載和卸載,在時鐘的操作幾乎沒有任何系統停機時間。
圖像分析系統的設計也讀取幻燈片獨特的條形碼,并涉及到一組特定的程序分析滑動所需的編碼信息。這種機制使系統來分析,在單次運行中的一個以上的類型的幻燈片。條碼系統的數據庫為基礎,樣品的歷史記錄和數據的寶庫的鑰匙。
而不是作為一個升降機,只是通過系統推幻燈片,幻燈片裝載機記得幻燈片的階段,甚至搬遷階段本身是一個微妙和敏感的工具。幻燈片會自動放在相同的位置在5微米。細致在載玻片上的樣品的顯微鏡檢查的基礎上的組織或細胞的病理調查。使用手工的方式,這個過程本質上是費時的,從一個訓練有素的操作員需要勤奮的濃度。
的Ariol系統的目的是消除手動滑動掃描所進行的組織或細胞懸浮液中的一幀一幀的圖像捕獲的負擔。這是通過一個高分辨率的裝置的電荷耦合器件(CCD)相機優化的低光敏感成像在整個光譜帶,它與一個高性能的奧林巴斯直立BX-61顯微鏡(奧林巴斯美國公司紐約州Melville)。由此產生的圖像質量非常高,他們在屏幕上顯示為高清晰度1600?1200像素的顯示器變成系統的自動評分的基礎。
顯卡使用系統,保證高圖像質量,可以解放員工從幾個小時盯著顯微鏡。然而,在這一領域的科學直接鏡檢的重要性是不會被遺忘。只需點擊鼠標,系統用戶可以記得幻燈片搬上舞臺近,眼觀看。
自動圖像分析系統的目的,不應該以除去或減少人的控制,而是根據需要與全手動控制選項提供的效率和自動化通過高。的Ariol配有其自己的完全可編程的操縱桿,鍵盤,鼠標和接口,通過該一系列的操作者可以交互地使用的圖像。雙顯示操作允許現場并排比較,或可讓用戶同時運行多個接口。
圖像分析和結果處理在病理學上,成像算法必然是任何系統的分析能力的核心。病理圖像分析的目的是專Ariol系統的成像算法。每個模塊的成像算法被開發協議IHC或FISH技術的一個特定類型為了使系統靈活在它的成像能力,分析算法都支持由一個所謂的可訓練的分類,使習慣于用戶系統的功能他或她個人的實驗室技術,以便它可以迅速適應一天到一天的運行變化和方法論。
進一步證明了系統的靈活性,在世界各地的實驗室在日常使用的各種應用程序。細胞Microsight罕見的事件檢測,膜IHC Hersight和ERsight PRsight核IHC模塊IVD使用。其他模塊,研究使用,而不是只診斷程序,被指定為IHC,細胞質DNA倍體,免疫熒光,微血管密度,前哨淋巴結細胞FISH,組織魚,組織芯片(TMA)應用。
圖像分析是一個資源密集型的過程。因此,該系統設有雙Xeon處理器的服務器級硬盤驅動器和內存,以及Windows XP Professional操作系統,確保沒有積壓的快速分析。除了分析滑梯,自動圖像分析系統應配備的功能,提高病理實驗室中進行后期效率。因此,應用成像了Ariol的報表生成,數據歸檔和聯網功能。
系統生成全彩電子報告,可以包括重要的細胞或組織的圖像分析,數值數據和成績,診斷意見,并簽名的空間。消除紙報告所需的時間承諾,此功能可確保數據通信的清晰度和一致性,報告,電子郵件和傳真準備的結果。支持整齊,符合成本效益的歸檔,該系統提供一個完整的臨床數據管理服務器,TB的硬盤空間,10 GB的數字視頻隨機存取記憶光盤,當然,郵編,甚至軟盤。
這個數字為高通量的操作技術的潛力得到充分發揮,通過系統聯網。的病理學家不必擠在顯微鏡時,他們能夠審查的情況下,包括清晰,高品質的圖像,從他們的辦公室桌面PC。除了經營作為一個單一的單機系統,可以配置不同的地方,坐落在實驗室或部門(參見圖3)的的多次復查電臺和筆記本電腦數據錄入站Ariol。審查站啟用的病理學家或實驗室主任審查正在進行的工作,審查和簽署的案件,并優化系統的報告和歸檔數據。數據輸入站可以被定位到寄存器每個顯微鏡載片上,因為它涉及到實驗室。
到現有的第三方實驗室信息系統,圖像和數據可以無縫集成所產生的Ariol系統的。這是通過系統的先進性,采用平臺無關的,非特定于供應商的XML技術的Web服務。
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